כיום התיאוריה של הופעת היקום הפכה ידועה באופן כללי, ומסבירה את מקור החומר מנקודה חומרית ראשונית מסוימת. מושג זה נקרא תיאוריית המפץ הגדול.
על פי תיאוריה זו, החומר הראשוני היה נקודה שנדחסה בטמפרטורה ובצפיפות גבוהה מאוד. בנקודת זמן מסוימת אירע פיצוץ, והנקודה החלה לצמוח בקצב מדהים. במקביל הופיע ענן שממנו צמחו אטומים, מולקולות, כוכבי לכת, כוכבים - כך קם היקום. התהליך שתואר לעיל לא יכול להיות מקרה בודד. אם פיצוץ כזה חוזר על עצמו שוב, יתכנו יקומים אחרים שאינם שונים בפרמטרים ובמאפיינים מהיקום שלנו. כיום, רוב המדענים סבורים על קיומם של קבוצה מסוימת של יקומים, שאחד מהם אנו יכולים להתבונן מבפנים. יתכן שביקום אחר אין חיים כלל, ובהתאם לכך אין בו משקיפים. החלופות לתפיסת המפץ הגדול הן: מודל התנודה של היקום והמודל הקוונטי. המודל הראשון מניח שחומר קיים תמיד, גדל ויורד במרווחי זמן שונים. יתר על כן, כל מחזורי השינוי מלווים במפץ גדול. המודל הקוונטי מניח שכל החלקיקים האלמנטריים יכולים להופיע פתאום ולהיעלם בחלל ריק, מה שמסביר את הופעת היקום והחומר. הוואקום עצמו הוא ניטרלי: אין לו מטען, אין מסה או כל פרמטרים אחרים. יתכן שהוואקום כולל סוג כלשהו של מטריצה, לפיה קרינה וחומר יכולים להיווצר. התיאולוגיה שוקלת גם את השאלה כיצד מקור היקום. המאמינים באלוהים מסבירים את הופעת היקום על ידי יצירת אלוהות עליונה, שיצרה חיים יש מאין תוך מספר ימים. התיאוריה המכניסטית של הופעת סלניום מסבירה את תהליך יצירת החומר, תוצאה של הפעלת חוקי טבע מובנים למדי. בנוסף, התומכים בתפיסה זו של הופעת כל החומר מכחישים לחלוטין את קיומם של כוחות עליונים או אלוהות אוניברסלית.
