ביולי 2012 אומץ צו לפיו כל קציני FSB, כמו גם אנשים המעוניינים להיכנס למוסד חינוכי FSB או להתחיל לכהן, יידרשו לעבור בדיקת סמים. הוחלט כי הבדיקות יחלו בנובמבר 2012.
בדיקת סמים של עובדי FSB, כמו גם אנשים שמתכוונים לעבוד במבנה זה, קשורה בעיקר להגדרת התאמה מקצועית. העובדה שמכורים לסמים עשויים להיכלל בשירות הביטחון, מעוררת דאגה רצינית לרשויות. הודות לתוצאות הבדיקות, מתוכנן לפנות את שורות עובדי שירות הביטחון מאנשים לא רצויים ובכך לשפר את איכות עבודתם. ולבסוף, ה- FSB יוכל להקים מבחר הדוק יותר של מועמדים ולהגן על עצמו מגיוס מכורים לסמים צעירים.
מעניין שהבדיקה תעזור לזהות לא רק את אלו שהשתמשו לאחרונה בסמים, אלא גם את אלו שניסו אותם לפחות פעם אחת, גם אם לפני שנים רבות. לשם כך, בנוסף להליך הסטנדרטי, הכולל מחקר מעבדה בנוזלים ביולוגיים, תבוצע בדיקה פסיכולוגית ושיחה באמצעות פוליגרף. אם יתגלה כי קצין ה- FSB השתמש בחומרים נרקוטיים או פסיכוטרופיים, המומחים יבצעו תחילה בדיקה מפורטת יותר ואז יעבירו דו ח מפורט לרשויות. לאחר בחינת הדוח, ההנהלה תחליט באיזו פעולה תנקוט.
בדיקות מתוזמנות ולא מתוזמנות יבוצעו. הראשונים מיועדים לכל אנשי הצבא והאזרחים המעורבים ישירות בעבודה במועצה הפדרלית, כמו גם למועמדים המעוניינים להיכנס למוסד חינוך או שירות מיוחד. זה יעזור לזהות אנשים שאינם מתאימים לעבודה בשירות הביטחון ולנקוט בצעדים הנדרשים ביחס אליהם. בדיקות לא מתוזמנות יבוצעו באופן אישי עבור אותם עובדים החשודים בשימוש בסמים, וכן עבור אנשים הסובלים מהפטיטיס B או C.
הוראות מפורטות כיצד לערוך בדיקות סמים בשורות קציני FSB ניתנות בצו "על אישור ההוראה לארגון וביצוע בדיקת חובה לשימוש בתרופות נרקוטיות וחומרים פסיכוטרופיים בגופי שירות הביטחון הפדרלי".
