אחת המצוות העיקריות של הנצרות היא אהבה לרעך. הכנסיה הנוצרית מנוגדת באופן מוחלט לפגיעה באדם, נפשי ופיזי. אחד החטאים הגרועים והראשונים בתולדות האנושות היה הרצח שבגינו קילל את קין. בתקופה המודרנית, הכנסיה רואה בהפלה גם רצח.
התוצאה של התערבות רפואית בניתוח ההפלה היא סיום חיי העובר עוד ברחם. הכנסייה תמיד הגנה על הילדים שטרם נולדו, והגנה על זכותם לחיים. על פי תורת האמונה האורתודוכסית, נפש האדם נוצרת בדיוק ברגע ההתעברות, ולכן הפרי עצמו הוא כבר אישיות אנושית חיה. במידה זו, כל מניפולציה המונעת לידת תינוק היא למעשה רצח רפואי של הילד.
כמו כן, יש לכנסייה גישה שלילית כלפי הפלות ובשל העובדה שהיא פוגעת ישירות בבריאות האם. זה יכול לגרום לבעיות פסיכולוגיות חמורות לא רק פיזיולוגיות.
יש לציין כי הכנסייה האורתודוכסית יכולה לאפשר הפלה רק במקרה של איום על חיי האם במהלך הלידה או במהלך ההריון. אם יש ברירה, האם האם ניצלת. זו נקודת המבט הרשמית של הרופאים והכנסייה. אך אם מבצעים הפלה רק בגלל חוסר רצון להביא לעולם ילד או כל מניעה אחרת שאינה מבוססת על אינדיקציות רפואיות, אז לא רק האם אשמה במותו של התינוק, אלא גם כל מי ששכנע את האישה הפלה. כולל רופא שנתן לכך אישור ללא ראיות רפואיות.
את חטא ההפלה, הנקרא גם רצח של ילד שטרם נולד, יש לומר בווידוי בתחושת תשובה מכל הלב.