על פי הדוקטרינה האורתודוכסית, קודש הקודש מורכב מאכילת מאמינים במסווה של לחם ויין מהותם האמיתי של גופו ודם של האדון ישוע המשיח. קודש הקודש הוא אחד משבע הקודש האורתודוכסי בו האדם מאוחד עם אלוהים.
הקמת קודש הקודש אינה חלה על פקודת האדם או על המצאת אנשי הדת. אם נפנה לנרטיב הבשורה, יהיה ברור כי הקודש של הקודש (הקודש) הוקם על ידי האדון ישוע המשיח עצמו.
את הקודש של הקודש הקים המושיע זמן קצר לפני מות הצלב - ביום חמישי. עד היום, יום זה נקרא "יום חמישי מאונד" כסימן שזו תקופה מיוחדת לטיהור נפש האדם ואיחוד האחרון עם האל. כפי שמספרים הבשורות, במהלך סעודת הקודש בחדר העליון של ציון, לקח המשיח לחם, שבר אותו וחילק אותו לתלמידיו לשליחים במילים שזהו הגוף האמיתי של בן האלוהים. יתר על כן, המושיע בירך את כוס היין באומרו שזו הדם שלו. האדון עצמו ציווה לבצע את הקודש הזה לזכרו.
הקודש של הקודש התקיים כבר במאות הראשונות של הנצרות. אז מההיסטוריה של הכנסייה ידוע שהמאמינים התכנסו בסתר מהשלטונות האליליים, ביצעו שירותים אלוהיים ולקחו את הקודש של גופו ודם המשיח, והגשימו את ברית הגואל.
הצורך בקידוש הקודש נקבע גם בבשורה. המשיח עצמו אמר כי הקהילה היא הכרחית כדי שיהיו חיים בעצמך. הבשורה מדברת על איחוד עם אלוהים בקודש הקודש. המשיח הטיף את הבשורה כי אותם אנשים שמקבלים קהילה שוכנים בו (האדון ישוע המשיח) והאדון עצמו שומר בהם.