העונה השלישית של סדרת המדע בדיוני האמריקאית Top Secret, שכללה 24 פרקים, החלה ב- 22 בספטמבר 1995 ונמשכה עד 17 במאי 1996. השידור בוצע על ידי פוקס. הסדרה המשיכה וסיפרה את סיפורם של הסוכנים המיוחדים של האף-בי-איי (האף-בי-איי - פוקס מולדר (דייוויד דוכובני) ודני סאלי (ג'יליאן אנדרסון). הדמויות הראשיות חוקרות מקרים של תופעות פאראנורמליות ומסתוריות המכונות המקרה "איקס").
העונה סיימה סדרת עלילות שהחלה בעונה השנייה והציגה כמה אלמנטים עלילתיים חדשים. הנרטיב העיקרי מתרכז בקונספירציה שמטרתה לכסות את הסרטון הנרכש של מולדר על נתיחת הנכרית, החיפוש של סקאלי אחר הרוצח של אחותה, והמסתורין סביב מר איקס (סטיבן וויליאמס). בפעם הראשונה דמויות כמו הזקן הראשון (דון סק. וויליאמס) והנגיף החייזרי השחור נכנסו לעלילת העונה השלישית. בנוסף, העונה כוללת מגוון רחב של "מפלצות השבוע": פרקים מכילים סיפורים עצמאיים ואינם משפיעים על המיתולוגיה הכוללת של הסדרה.
העונה עלתה על הדירוג של השניים הקודמים. פרק הבכורה "נתיב מבורך" עלה לראשונה בדירוג של נילסן של 19.94 מיליון צופים, כפול מבכורת העונה הקודמת. לאורך ההקרנות, הרייטינג עלה באופן עקבי על 15 מיליון צופים, מה שהפך אותה לאחת הסדרות הנצפות ביותר בטלוויזיה האמריקאית בעונת 1995-1996. העונה קיבלה ביקורות חיוביות בעיקר ממבקרי הטלוויזיה, וזכתה בחמישה פרסי אמי. נכתב על ידי דרין מורגן, פרקים רבים, כמו המנוחה האחרונה של קלייד ברקמן ו- Out of Space של ג'ו צ'אנג, זכו לשבחי הביקורת כחלק מהטובים בסדרה. מורגן עזב את הסדרה לאחר שסיים את עונה 3 בגלל שלא עמד בקצב הדינמי של התוכנית. הוא חזר רק בעונות העשירית והאחת עשרה.
עלילה
סוכן ה- FBI פוקס מולדר נמצא חצי מת במדבר לאחר שאיש עישון הסיגריות מורה לצבא לשרוף כרכרה של עדויות מדעיות, מבלי לדעת שמולדר נמצא בפנים. אינוואדו אינדיאני, אלברט גוסטין, מחזיר את פוקס מולדר לחיים. בינתיים, סקאלי בוחנת את המעורבות האפשרית של תוכנית הדברת אבעבועות שחורות לפני ניסויים גנטיים בבני אדם. היא גילתה כי מדען נאצי שברח לארצות הברית לאחר מלחמת העולם השנייה, במהלך מבצע "מהדק נייר", ניסה ליצור הכלאה של בן אנוש וחייזר. כתוצאה מכך, סקאלי נרצחת ונהרגת בטעות על ידי אחותה מליסה, שטועה בדיינה עצמה.
בחקירת עדויות לנתיחה של חייזרים, מולדר עוקב אחר הובלת הרכבת הממשלתית הסודית של הכלאה של בן אנוש וחייזר. פוקס מצליח להיכנס לאחת המכוניות האלה, שם הוא כמעט נהרג על ידי שומרי הסינדיקט. עם זאת, המודיע מיסטר X יציל אותו. סקאלי, בינתיים, יוצאת לקבוצת נשים ששרדה גם חטיפות דומות לה, ופוגשת חברה אחרת בסינדיקט, המכונה הזקנה הראשונה, שטוענת כי במהלך חטיפתה הושמה בכרכרה דומה והייתה קורבן לניסויים של מדענים יפנים.
הצוות של ספינת הצלה צרפתית, שמנסה להרים צוללת מתקופת מלחמת העולם השנייה מקרקעית הים, נופל טרף לקרינה. היוצא מן הכלל היחיד הוא צוללן שחלה בטפיל שנמצא בצוללת. הנגיף החיצוני הזה, ששולט בגופות הקורבנות, תפס בסופו של דבר את גופתו של אלכס קריצ'ק, בחיפוש אחר מי שהלך פוקס מולדר, ולקח אותו למעצרו.כתוצאה מכך הושם קריצ'ק הנגוע בממגורת רקטות ששימשה להסתרת עב ם והטפיל עזב את גופתו. בינתיים, סקאלי מצליחה לאתר את לואיס קרדינל, האיש שאחראי לרצח אחותה.
ללהק
פוקס מולדר, סוכן מיוחד של האף-בי-איי שעובד ביחידה המיוחדת עם חותמת איקס. מקבל קלטת עם מסמכים סודיים ביותר של משרד ההגנה האמריקני ומנסה לפענח אותם כדי לא רק להוכיח את אמונותיו, אלא גם לגלות את האמת על אביו. ניסיונות לפענח את המסמכים מובילים אותו לשמורה הודית בניו מקסיקו.
- דנה סקאלי, הסוכנת המיוחדת של האף-בי-איי, רופאה ומדען שעובדת ביחידה המיוחדת עם חותמת ה- X. הוא הופך לקורבן של חטיפה, שהיעדים והאנשים המעורבים בהם נותרים עלומים. מנסה לעזור למולדר לחשוף את האמת, למרות שלא תמך באמונותיו.
